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DNA分子是一種自身不會發出熒光的大分子，需要相應的核酸分子染料結合到DNA分子的大溝處，通過激發光激發DNA –核酸染料復合物，復合物會發出一束強熒光，通過相應的濾光片過濾得到單波長的發射光，通過照相機或者肉眼捕獲就能夠檢測到相應的DNA分子。那么瓊脂糖核酸電泳要選擇紫外還是藍光呢？讓我們一起來看看吧！
從核酸電泳發展至今，絕大多數的分子生物學實驗室選擇溴化乙錠（EtBr，也簡稱EB）作為核酸分子染料，由于EB的光譜特性，又不得不選擇紫外光作為激發光。EB分子因其分子量較小，容易透過細胞膜，因此是一種致癌性ji強的有機小分子。而紫外光（UV）照射也會誘發基因突變，不僅會引發實驗樣品的基因突變，也會對實驗人員造成一定的傷害。
為了解決EB分子的致癌問題，科研工作者通過有機合成技術將兩個EB分子通過有機分子鏈連在了一起，解決了EB分子因分子量比較小容易通過細胞膜的問題，連在一起的分子被稱為GelRed。這雖然解決了染料相對安全的問題，可激發光依然是UV，不能夠從本質上解決對實驗樣品和實驗操作者自身的安全問題。
事實上，除了EB和GelRed這兩種以UV為激發光的核酸分子染料，還存在另一類核酸分子染料，如：GelGreen、SYBR Green、SYBR Gold、LED Green、SYBR Safe、GoldView等以480nm藍光為激發光的核酸染料，這類染料分子量相對較大，細胞膜通透性較差，因此對實驗人員帶來的危害較小，相對EB分子是一種較安全的核酸分子染料。
由于波長470nm藍光屬于可見光，不會對實驗樣品造成破壞，也不會對實驗人員造成危害，因此470nm的藍光搭配安全核酸分子染料能夠zui大程度降低核酸瓊脂糖凝膠電泳帶來的潛在危險。
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